Le prépuce est un système de protection du corps. Tout comme les cheveux, les poils... cela remonte à une époque ancestrale...
De nos jours, avec des règles d'hygiène simple, le prépuce n'est plus une nécessité (cf la circonscision), mais il est normal que la nature ait chercher à protéger chez les mamifères par ce moyens les organes reproducteurs qui sont les garants de la survie d'une espèce. Chez les femmes, les organes reproducteurs sont protégés en étant à l'intérieur du corps, chez les hommes, il y a un prépuce.
D'ailleurs les médecins recommandent d'attendre que l'enfant soit propre pour effectuer la circonscision.